對于色譜分離模式的選擇應采用多種分析柱對分離條件進行測試，當有多種模式可以選擇時，應著重考慮下列因素，包括：

 

分辨率：即色譜填料對被測組分的選擇性

上樣量：即色譜填料對被測樣品的承載容量

分析速度：即對被測樣品的分離時間


制備柱分離性能測試步驟：

① 考慮到填料由分析級直接放大到制備級的因素，如果要純化大量的化合物，需要考慮分析柱的規格和可作為制備柱的填料粒徑（10µm或更大）；作為在下一步純化產品量更大的項目，必須考慮選擇更大的填料粒徑和更大內徑的色譜柱，在與分析柱相同的填料下對產品進行純化。

② 對分析柱（4.6mm內徑或更小）選擇性的研究，應在多種填料和多種色譜條件下進行選擇，可以采用一些商品的液相色譜條件選擇軟件進行多種色譜模式的比較選擇，這樣可以縮短分離條件選擇的時間。

③ 在得到*的分離條件后，需要對分析柱上樣品的承載量進行測試，比較多種上樣量下產物的純度，選擇產物純度的zui大上樣量。

④ 選擇制備柱的規格，要依據在分析柱上得到的上樣量數據，進行放大分離，通常選擇與分析柱相同粒徑的填料和色譜柱長度來達到推測制備分離的預測。放大制備柱的上樣量應基于制備柱和分析柱的交叉截面面積的比值來進行選擇。

⑤ 檢查制備色譜分離的結果和色譜餾出物的區域以及純度。