聚合物基質液相色譜柱主要基質的特點：

a.硅膠

硅膠是陶瓷性質的無機物基質，剛性大，不易變形。

化學性質較穩定，但對于水溶液尤其堿性水溶液仍然是不穩定的，即使表面經過良好的化學鍵合，覆蓋了固定液，還是要注意水、堿性溶液、酸性溶液對硅膠的溶解作用，基質或者說是柱床(packedbed)溶解對色譜柱的影響是致命的。

以聚合物基質液相色譜柱的填料構成了目前絕大多數的色譜柱填料。純硅膠填料適宜分離溶于有機溶劑的極性、弱極性的非強離解型的化合物，硅膠也可以做凝膠色譜但柱效較低。

聚合物基質液相色譜柱鍵合固定相的高壓液相填料，有其他填料*的高分離效能。

 

b.二氧化鋁

二氧化鋁和硅膠相似，但對水溶液、酸性堿性水溶液溶液更加不穩定。所以，極少用作鍵合固定相的基質，也是適宜分離溶于有機溶劑的極性、弱極性的非強離解型的化合物，尤其是分離芳香族碳氫化合物。酸性易離解的化合物容易在二氧化鋁上形成死吸附。另外，氧化鋁分離幾何異構體能力優于硅膠。

 

c.聚合物填料

聚合物基質液相色譜柱受壓會變形，壓力限度低但pH使用范圍寬。苯乙烯-二乙烯苯基質疏水性強，使用任何流動相，在整個pH范圍內穩定，可以用強酸、強堿來清洗色譜柱。甲基丙烯酸酯基質比苯乙烯-二乙烯苯疏水性更強，但可以通過適當的功能基修飾變成親水性的。  

由于不耐壓、有溶脹性，所以聚合物填料適宜用于大分子像蛋白質或合成的高聚物，另外還可以制成分子排阻、離子交換柱。大孔樹脂實際上主體就是苯乙烯-二乙烯苯聚合物或類似的合成高聚物。